Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NebE9Q1W3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NebE9Q1W3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NebE9Q1W3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NebE9Q1W3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NebE9Q1W3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NebE9Q1W3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NebE9Q1W3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NebE9Q1W3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NebE9Q1W3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NebE9Q1W3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NebE9Q1W3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NebE9Q1W3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NebE9Q1W3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NebE9Q1W3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NebE9Q1W3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NebE9Q1W3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NebE9Q1W3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NebE9Q1W3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NebE9Q1W3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms