Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrp3E9Q1T6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrp3E9Q1T6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrp3E9Q1T6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrp3E9Q1T6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrp3E9Q1T6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrp3E9Q1T6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrp3E9Q1T6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrp3E9Q1T6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrp3E9Q1T6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrp3E9Q1T6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrp3E9Q1T6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrp3E9Q1T6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrp3E9Q1T6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrp3E9Q1T6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp3E9Q1T6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrp3E9Q1T6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrp3E9Q1T6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp3E9Q1T6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrp3E9Q1T6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrp3E9Q1T6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrp3E9Q1T6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrp3E9Q1T6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrp3E9Q1T6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrp3E9Q1T6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrp3E9Q1T6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrp3E9Q1T6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrp3E9Q1T6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrp3E9Q1T6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrp3E9Q1T6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrp3E9Q1T6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrp3E9Q1T6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrp3E9Q1T6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrp3E9Q1T6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrp3E9Q1T6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrp3E9Q1T6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrp3E9Q1T6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrp3E9Q1T6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrp3E9Q1T6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrp3E9Q1T6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrp3E9Q1T6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrp3E9Q1T6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrp3E9Q1T6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrp3E9Q1T6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrp3E9Q1T6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrp3E9Q1T6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrp3E9Q1T6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrp3E9Q1T6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrp3E9Q1T6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrp3E9Q1T6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrp3E9Q1T6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrp3E9Q1T6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrp3E9Q1T6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrp3E9Q1T6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrp3E9Q1T6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrp3E9Q1T6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrp3E9Q1T6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrp3E9Q1T6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrp3E9Q1T6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrp3E9Q1T6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrp3E9Q1T6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrp3E9Q1T6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrp3E9Q1T6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrp3E9Q1T6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrp3E9Q1T6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrp3E9Q1T6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrp3E9Q1T6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrp3E9Q1T6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrp3E9Q1T6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrp3E9Q1T6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrp3E9Q1T6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrp3E9Q1T6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrp3E9Q1T6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrp3E9Q1T6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrp3E9Q1T6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrp3E9Q1T6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrp3E9Q1T6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrp3E9Q1T6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrp3E9Q1T6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrp3E9Q1T6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrp3E9Q1T6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrp3E9Q1T6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrp3E9Q1T6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrp3E9Q1T6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrp3E9Q1T6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrp3E9Q1T6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrp3E9Q1T6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrp3E9Q1T6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrp3E9Q1T6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrp3E9Q1T6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrp3E9Q1T6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrp3E9Q1T6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrp3E9Q1T6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrp3E9Q1T6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrp3E9Q1T6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrp3E9Q1T6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrp3E9Q1T6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrp3E9Q1T6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrp3E9Q1T6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrp3E9Q1T6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
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