Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1L0

Vmn2r80, Vomeronasal 2, receptor 80, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r80E9Q1L0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn2r80E9Q1L0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r80E9Q1L0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r80E9Q1L0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r80E9Q1L0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn2r80E9Q1L0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn2r80E9Q1L0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn2r80E9Q1L0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn2r80E9Q1L0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn2r80E9Q1L0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn2r80E9Q1L0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn2r80E9Q1L0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r80E9Q1L0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r80E9Q1L0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r80E9Q1L0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r80E9Q1L0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r80E9Q1L0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r80E9Q1L0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r80E9Q1L0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r80E9Q1L0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r80E9Q1L0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r80E9Q1L0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r80E9Q1L0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r80E9Q1L0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r80E9Q1L0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r80E9Q1L0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r80E9Q1L0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r80E9Q1L0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r80E9Q1L0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r80E9Q1L0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r80E9Q1L0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r80E9Q1L0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r80E9Q1L0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r80E9Q1L0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r80E9Q1L0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r80E9Q1L0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r80E9Q1L0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r80E9Q1L0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r80E9Q1L0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn2r80E9Q1L0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r80E9Q1L0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r80E9Q1L0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r80E9Q1L0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r80E9Q1L0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r80E9Q1L0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r80E9Q1L0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r80E9Q1L0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r80E9Q1L0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r80E9Q1L0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r80E9Q1L0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r80E9Q1L0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r80E9Q1L0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r80E9Q1L0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r80E9Q1L0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r80E9Q1L0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r80E9Q1L0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r80E9Q1L0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r80E9Q1L0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r80E9Q1L0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r80E9Q1L0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r80E9Q1L0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r80E9Q1L0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r80E9Q1L0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r80E9Q1L0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r80E9Q1L0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r80E9Q1L0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r80E9Q1L0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r80E9Q1L0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r80E9Q1L0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r80E9Q1L0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r80E9Q1L0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r80E9Q1L0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r80E9Q1L0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r80E9Q1L0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r80E9Q1L0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r80E9Q1L0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r80E9Q1L0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r80E9Q1L0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r80E9Q1L0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r80E9Q1L0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r80E9Q1L0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r80E9Q1L0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r80E9Q1L0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r80E9Q1L0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r80E9Q1L0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r80E9Q1L0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r80E9Q1L0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r80E9Q1L0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r80E9Q1L0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r80E9Q1L0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r80E9Q1L0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r80E9Q1L0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r80E9Q1L0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r80E9Q1L0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn2r80E9Q1L0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn2r80E9Q1L0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn2r80E9Q1L0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn2r80E9Q1L0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn2r80E9Q1L0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn2r80E9Q1L0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms