Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp558E9Q1J0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp558E9Q1J0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp558E9Q1J0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp558E9Q1J0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp558E9Q1J0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp558E9Q1J0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp558E9Q1J0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp558E9Q1J0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp558E9Q1J0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp558E9Q1J0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp558E9Q1J0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp558E9Q1J0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp558E9Q1J0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp558E9Q1J0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zfp558E9Q1J0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zfp558E9Q1J0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp558E9Q1J0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp558E9Q1J0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp558E9Q1J0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp558E9Q1J0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfp558E9Q1J0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfp558E9Q1J0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp558E9Q1J0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp558E9Q1J0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp558E9Q1J0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp558E9Q1J0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp558E9Q1J0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp558E9Q1J0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp558E9Q1J0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp558E9Q1J0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp558E9Q1J0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp558E9Q1J0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp558E9Q1J0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp558E9Q1J0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp558E9Q1J0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp558E9Q1J0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfp558E9Q1J0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfp558E9Q1J0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfp558E9Q1J0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfp558E9Q1J0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfp558E9Q1J0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfp558E9Q1J0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Zfp558E9Q1J0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfp558E9Q1J0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfp558E9Q1J0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfp558E9Q1J0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfp558E9Q1J0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfp558E9Q1J0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfp558E9Q1J0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp558E9Q1J0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp558E9Q1J0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp558E9Q1J0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp558E9Q1J0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp558E9Q1J0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp558E9Q1J0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfp558E9Q1J0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp558E9Q1J0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp558E9Q1J0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp558E9Q1J0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp558E9Q1J0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp558E9Q1J0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp558E9Q1J0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp558E9Q1J0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp558E9Q1J0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp558E9Q1J0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp558E9Q1J0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp558E9Q1J0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms