Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
2610021A01RikE9Q0Q3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
2610021A01RikE9Q0Q3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2610021A01RikE9Q0Q3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
2610021A01RikE9Q0Q3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
2610021A01RikE9Q0Q3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
2610021A01RikE9Q0Q3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms