Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0P0

Gm8127, Predicted gene 8127, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8127E9Q0P0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8127E9Q0P0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8127E9Q0P0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8127E9Q0P0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8127E9Q0P0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8127E9Q0P0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8127E9Q0P0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8127E9Q0P0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8127E9Q0P0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8127E9Q0P0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8127E9Q0P0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8127E9Q0P0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8127E9Q0P0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8127E9Q0P0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8127E9Q0P0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8127E9Q0P0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8127E9Q0P0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8127E9Q0P0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8127E9Q0P0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8127E9Q0P0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8127E9Q0P0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8127E9Q0P0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8127E9Q0P0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8127E9Q0P0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8127E9Q0P0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8127E9Q0P0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8127E9Q0P0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8127E9Q0P0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm8127E9Q0P0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8127E9Q0P0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8127E9Q0P0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm8127E9Q0P0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm8127E9Q0P0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm8127E9Q0P0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8127E9Q0P0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8127E9Q0P0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8127E9Q0P0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8127E9Q0P0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8127E9Q0P0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8127E9Q0P0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8127E9Q0P0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8127E9Q0P0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8127E9Q0P0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8127E9Q0P0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8127E9Q0P0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm8127E9Q0P0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm8127E9Q0P0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8127E9Q0P0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8127E9Q0P0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8127E9Q0P0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8127E9Q0P0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8127E9Q0P0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8127E9Q0P0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8127E9Q0P0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8127E9Q0P0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8127E9Q0P0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8127E9Q0P0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8127E9Q0P0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8127E9Q0P0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8127E9Q0P0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8127E9Q0P0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8127E9Q0P0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8127E9Q0P0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8127E9Q0P0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm8127E9Q0P0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8127E9Q0P0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8127E9Q0P0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8127E9Q0P0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8127E9Q0P0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8127E9Q0P0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8127E9Q0P0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8127E9Q0P0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8127E9Q0P0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8127E9Q0P0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8127E9Q0P0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8127E9Q0P0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8127E9Q0P0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8127E9Q0P0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8127E9Q0P0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8127E9Q0P0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8127E9Q0P0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8127E9Q0P0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8127E9Q0P0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8127E9Q0P0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8127E9Q0P0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8127E9Q0P0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8127E9Q0P0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8127E9Q0P0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8127E9Q0P0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8127E9Q0P0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8127E9Q0P0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8127E9Q0P0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8127E9Q0P0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8127E9Q0P0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8127E9Q0P0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8127E9Q0P0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8127E9Q0P0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8127E9Q0P0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8127E9Q0P0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8127E9Q0P0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms