Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdr1E9Q0B4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdr1E9Q0B4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdr1E9Q0B4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdr1E9Q0B4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdr1E9Q0B4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdr1E9Q0B4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdr1E9Q0B4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdr1E9Q0B4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdr1E9Q0B4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdr1E9Q0B4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdr1E9Q0B4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdr1E9Q0B4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdr1E9Q0B4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdr1E9Q0B4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdr1E9Q0B4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdr1E9Q0B4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdr1E9Q0B4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdr1E9Q0B4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdr1E9Q0B4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdr1E9Q0B4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdr1E9Q0B4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdr1E9Q0B4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdr1E9Q0B4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdr1E9Q0B4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdr1E9Q0B4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdr1E9Q0B4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdr1E9Q0B4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdr1E9Q0B4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdr1E9Q0B4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdr1E9Q0B4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdr1E9Q0B4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdr1E9Q0B4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdr1E9Q0B4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdr1E9Q0B4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdr1E9Q0B4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdr1E9Q0B4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdr1E9Q0B4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdr1E9Q0B4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdr1E9Q0B4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdr1E9Q0B4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdr1E9Q0B4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdr1E9Q0B4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdr1E9Q0B4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdr1E9Q0B4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdr1E9Q0B4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdr1E9Q0B4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdr1E9Q0B4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdr1E9Q0B4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdr1E9Q0B4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdr1E9Q0B4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdr1E9Q0B4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdr1E9Q0B4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cdr1E9Q0B4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdr1E9Q0B4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdr1E9Q0B4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdr1E9Q0B4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdr1E9Q0B4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdr1E9Q0B4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdr1E9Q0B4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdr1E9Q0B4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdr1E9Q0B4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdr1E9Q0B4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdr1E9Q0B4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdr1E9Q0B4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdr1E9Q0B4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdr1E9Q0B4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdr1E9Q0B4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdr1E9Q0B4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdr1E9Q0B4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdr1E9Q0B4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdr1E9Q0B4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdr1E9Q0B4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdr1E9Q0B4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdr1E9Q0B4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cdr1E9Q0B4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cdr1E9Q0B4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cdr1E9Q0B4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdr1E9Q0B4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdr1E9Q0B4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdr1E9Q0B4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdr1E9Q0B4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdr1E9Q0B4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdr1E9Q0B4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdr1E9Q0B4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdr1E9Q0B4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdr1E9Q0B4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdr1E9Q0B4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdr1E9Q0B4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdr1E9Q0B4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdr1E9Q0B4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdr1E9Q0B4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdr1E9Q0B4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdr1E9Q0B4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdr1E9Q0B4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdr1E9Q0B4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdr1E9Q0B4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdr1E9Q0B4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdr1E9Q0B4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdr1E9Q0B4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms