Protein–RNA interactions for Protein: E9Q048

Ermard, ER membrane-associated RNA degradation, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErmardE9Q048 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ErmardE9Q048 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ErmardE9Q048 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ErmardE9Q048 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ErmardE9Q048 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ErmardE9Q048 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ErmardE9Q048 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ErmardE9Q048 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ErmardE9Q048 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ErmardE9Q048 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ErmardE9Q048 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ErmardE9Q048 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ErmardE9Q048 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ErmardE9Q048 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ErmardE9Q048 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ErmardE9Q048 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ErmardE9Q048 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ErmardE9Q048 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ErmardE9Q048 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ErmardE9Q048 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ErmardE9Q048 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ErmardE9Q048 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ErmardE9Q048 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ErmardE9Q048 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ErmardE9Q048 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ErmardE9Q048 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ErmardE9Q048 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ErmardE9Q048 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ErmardE9Q048 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ErmardE9Q048 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ErmardE9Q048 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ErmardE9Q048 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ErmardE9Q048 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ErmardE9Q048 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ErmardE9Q048 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ErmardE9Q048 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ErmardE9Q048 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ErmardE9Q048 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ErmardE9Q048 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ErmardE9Q048 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ErmardE9Q048 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ErmardE9Q048 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ErmardE9Q048 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ErmardE9Q048 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ErmardE9Q048 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ErmardE9Q048 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ErmardE9Q048 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ErmardE9Q048 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ErmardE9Q048 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ErmardE9Q048 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ErmardE9Q048 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ErmardE9Q048 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ErmardE9Q048 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ErmardE9Q048 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ErmardE9Q048 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ErmardE9Q048 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ErmardE9Q048 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ErmardE9Q048 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ErmardE9Q048 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ErmardE9Q048 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ErmardE9Q048 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ErmardE9Q048 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ErmardE9Q048 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ErmardE9Q048 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ErmardE9Q048 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ErmardE9Q048 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ErmardE9Q048 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ErmardE9Q048 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ErmardE9Q048 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ErmardE9Q048 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ErmardE9Q048 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ErmardE9Q048 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ErmardE9Q048 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ErmardE9Q048 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ErmardE9Q048 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ErmardE9Q048 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ErmardE9Q048 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ErmardE9Q048 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ErmardE9Q048 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ErmardE9Q048 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ErmardE9Q048 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ErmardE9Q048 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ErmardE9Q048 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ErmardE9Q048 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ErmardE9Q048 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ErmardE9Q048 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ErmardE9Q048 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ErmardE9Q048 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ErmardE9Q048 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ErmardE9Q048 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ErmardE9Q048 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ErmardE9Q048 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ErmardE9Q048 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ErmardE9Q048 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ErmardE9Q048 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ErmardE9Q048 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ErmardE9Q048 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ErmardE9Q048 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ErmardE9Q048 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ErmardE9Q048 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms