Protein–RNA interactions for Protein: E9PXJ8

Vmn2r90, Vomeronasal 2, receptor 90, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r90E9PXJ8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn2r90E9PXJ8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn2r90E9PXJ8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn2r90E9PXJ8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn2r90E9PXJ8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn2r90E9PXJ8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn2r90E9PXJ8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn2r90E9PXJ8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn2r90E9PXJ8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn2r90E9PXJ8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn2r90E9PXJ8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vmn2r90E9PXJ8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vmn2r90E9PXJ8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn2r90E9PXJ8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn2r90E9PXJ8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn2r90E9PXJ8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn2r90E9PXJ8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn2r90E9PXJ8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn2r90E9PXJ8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn2r90E9PXJ8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn2r90E9PXJ8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn2r90E9PXJ8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn2r90E9PXJ8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn2r90E9PXJ8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn2r90E9PXJ8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn2r90E9PXJ8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn2r90E9PXJ8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn2r90E9PXJ8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn2r90E9PXJ8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn2r90E9PXJ8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn2r90E9PXJ8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn2r90E9PXJ8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn2r90E9PXJ8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vmn2r90E9PXJ8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn2r90E9PXJ8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn2r90E9PXJ8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn2r90E9PXJ8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r90E9PXJ8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r90E9PXJ8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r90E9PXJ8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r90E9PXJ8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r90E9PXJ8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r90E9PXJ8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn2r90E9PXJ8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn2r90E9PXJ8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn2r90E9PXJ8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r90E9PXJ8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r90E9PXJ8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r90E9PXJ8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r90E9PXJ8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn2r90E9PXJ8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r90E9PXJ8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r90E9PXJ8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r90E9PXJ8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r90E9PXJ8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vmn2r90E9PXJ8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r90E9PXJ8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r90E9PXJ8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r90E9PXJ8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r90E9PXJ8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r90E9PXJ8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r90E9PXJ8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r90E9PXJ8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r90E9PXJ8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r90E9PXJ8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r90E9PXJ8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r90E9PXJ8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r90E9PXJ8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn2r90E9PXJ8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn2r90E9PXJ8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn2r90E9PXJ8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn2r90E9PXJ8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn2r90E9PXJ8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn2r90E9PXJ8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn2r90E9PXJ8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn2r90E9PXJ8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn2r90E9PXJ8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r90E9PXJ8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r90E9PXJ8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn2r90E9PXJ8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn2r90E9PXJ8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn2r90E9PXJ8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r90E9PXJ8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r90E9PXJ8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r90E9PXJ8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r90E9PXJ8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r90E9PXJ8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r90E9PXJ8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r90E9PXJ8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r90E9PXJ8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r90E9PXJ8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmn2r90E9PXJ8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r90E9PXJ8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r90E9PXJ8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r90E9PXJ8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r90E9PXJ8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r90E9PXJ8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r90E9PXJ8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r90E9PXJ8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r90E9PXJ8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms