Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifit3bE9PV48 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifit3bE9PV48 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifit3bE9PV48 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ifit3bE9PV48 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifit3bE9PV48 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ifit3bE9PV48 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ifit3bE9PV48 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ifit3bE9PV48 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifit3bE9PV48 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifit3bE9PV48 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifit3bE9PV48 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ifit3bE9PV48 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifit3bE9PV48 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifit3bE9PV48 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifit3bE9PV48 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifit3bE9PV48 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifit3bE9PV48 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifit3bE9PV48 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifit3bE9PV48 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifit3bE9PV48 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifit3bE9PV48 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifit3bE9PV48 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifit3bE9PV48 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifit3bE9PV48 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifit3bE9PV48 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifit3bE9PV48 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifit3bE9PV48 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifit3bE9PV48 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifit3bE9PV48 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifit3bE9PV48 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifit3bE9PV48 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifit3bE9PV48 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifit3bE9PV48 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifit3bE9PV48 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifit3bE9PV48 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifit3bE9PV48 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifit3bE9PV48 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifit3bE9PV48 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifit3bE9PV48 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifit3bE9PV48 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifit3bE9PV48 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifit3bE9PV48 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifit3bE9PV48 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifit3bE9PV48 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifit3bE9PV48 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifit3bE9PV48 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifit3bE9PV48 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifit3bE9PV48 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifit3bE9PV48 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifit3bE9PV48 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifit3bE9PV48 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifit3bE9PV48 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifit3bE9PV48 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifit3bE9PV48 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifit3bE9PV48 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifit3bE9PV48 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifit3bE9PV48 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifit3bE9PV48 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifit3bE9PV48 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifit3bE9PV48 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifit3bE9PV48 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifit3bE9PV48 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifit3bE9PV48 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifit3bE9PV48 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifit3bE9PV48 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifit3bE9PV48 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifit3bE9PV48 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifit3bE9PV48 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifit3bE9PV48 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifit3bE9PV48 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifit3bE9PV48 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifit3bE9PV48 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifit3bE9PV48 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifit3bE9PV48 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifit3bE9PV48 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifit3bE9PV48 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifit3bE9PV48 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifit3bE9PV48 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifit3bE9PV48 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifit3bE9PV48 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifit3bE9PV48 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifit3bE9PV48 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifit3bE9PV48 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifit3bE9PV48 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ifit3bE9PV48 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifit3bE9PV48 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifit3bE9PV48 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifit3bE9PV48 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifit3bE9PV48 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifit3bE9PV48 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifit3bE9PV48 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifit3bE9PV48 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifit3bE9PV48 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifit3bE9PV48 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ifit3bE9PV48 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ifit3bE9PV48 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifit3bE9PV48 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifit3bE9PV48 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifit3bE9PV48 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms