Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FgaE9PV24 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FgaE9PV24 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FgaE9PV24 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FgaE9PV24 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FgaE9PV24 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FgaE9PV24 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FgaE9PV24 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FgaE9PV24 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FgaE9PV24 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FgaE9PV24 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FgaE9PV24 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FgaE9PV24 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FgaE9PV24 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FgaE9PV24 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FgaE9PV24 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FgaE9PV24 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FgaE9PV24 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FgaE9PV24 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FgaE9PV24 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FgaE9PV24 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FgaE9PV24 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FgaE9PV24 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FgaE9PV24 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FgaE9PV24 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FgaE9PV24 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FgaE9PV24 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FgaE9PV24 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FgaE9PV24 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FgaE9PV24 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FgaE9PV24 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FgaE9PV24 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FgaE9PV24 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FgaE9PV24 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FgaE9PV24 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FgaE9PV24 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FgaE9PV24 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FgaE9PV24 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FgaE9PV24 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FgaE9PV24 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FgaE9PV24 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FgaE9PV24 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FgaE9PV24 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FgaE9PV24 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FgaE9PV24 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FgaE9PV24 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FgaE9PV24 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FgaE9PV24 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FgaE9PV24 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FgaE9PV24 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FgaE9PV24 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FgaE9PV24 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FgaE9PV24 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FgaE9PV24 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FgaE9PV24 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FgaE9PV24 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FgaE9PV24 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FgaE9PV24 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FgaE9PV24 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FgaE9PV24 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FgaE9PV24 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FgaE9PV24 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FgaE9PV24 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FgaE9PV24 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FgaE9PV24 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FgaE9PV24 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FgaE9PV24 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FgaE9PV24 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FgaE9PV24 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FgaE9PV24 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FgaE9PV24 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FgaE9PV24 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FgaE9PV24 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FgaE9PV24 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FgaE9PV24 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FgaE9PV24 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FgaE9PV24 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FgaE9PV24 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FgaE9PV24 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FgaE9PV24 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FgaE9PV24 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FgaE9PV24 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FgaE9PV24 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FgaE9PV24 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FgaE9PV24 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FgaE9PV24 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FgaE9PV24 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FgaE9PV24 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FgaE9PV24 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FgaE9PV24 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FgaE9PV24 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FgaE9PV24 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FgaE9PV24 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FgaE9PV24 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FgaE9PV24 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FgaE9PV24 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FgaE9PV24 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FgaE9PV24 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FgaE9PV24 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FgaE9PV24 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms