Protein–RNA interactions for Protein: E9PUW8

Ccdc24, Coiled-coil domain-containing 24, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc24E9PUW8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc24E9PUW8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc24E9PUW8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc24E9PUW8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc24E9PUW8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc24E9PUW8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc24E9PUW8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc24E9PUW8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc24E9PUW8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ccdc24E9PUW8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc24E9PUW8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc24E9PUW8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc24E9PUW8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc24E9PUW8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc24E9PUW8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc24E9PUW8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc24E9PUW8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc24E9PUW8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc24E9PUW8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc24E9PUW8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc24E9PUW8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc24E9PUW8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc24E9PUW8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc24E9PUW8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc24E9PUW8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc24E9PUW8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc24E9PUW8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc24E9PUW8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc24E9PUW8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc24E9PUW8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc24E9PUW8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc24E9PUW8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc24E9PUW8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc24E9PUW8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc24E9PUW8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc24E9PUW8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc24E9PUW8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc24E9PUW8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc24E9PUW8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc24E9PUW8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc24E9PUW8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc24E9PUW8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc24E9PUW8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc24E9PUW8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc24E9PUW8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc24E9PUW8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc24E9PUW8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc24E9PUW8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc24E9PUW8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc24E9PUW8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc24E9PUW8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc24E9PUW8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc24E9PUW8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc24E9PUW8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc24E9PUW8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc24E9PUW8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc24E9PUW8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc24E9PUW8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc24E9PUW8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc24E9PUW8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc24E9PUW8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc24E9PUW8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc24E9PUW8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc24E9PUW8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc24E9PUW8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc24E9PUW8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc24E9PUW8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc24E9PUW8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc24E9PUW8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc24E9PUW8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc24E9PUW8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc24E9PUW8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc24E9PUW8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc24E9PUW8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc24E9PUW8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc24E9PUW8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc24E9PUW8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc24E9PUW8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc24E9PUW8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc24E9PUW8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc24E9PUW8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc24E9PUW8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc24E9PUW8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc24E9PUW8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc24E9PUW8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc24E9PUW8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc24E9PUW8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc24E9PUW8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc24E9PUW8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc24E9PUW8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc24E9PUW8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc24E9PUW8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc24E9PUW8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc24E9PUW8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc24E9PUW8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc24E9PUW8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc24E9PUW8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc24E9PUW8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc24E9PUW8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc24E9PUW8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms