Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BC035044E0CXF8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BC035044E0CXF8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BC035044E0CXF8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BC035044E0CXF8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BC035044E0CXF8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BC035044E0CXF8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BC035044E0CXF8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BC035044E0CXF8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BC035044E0CXF8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC035044E0CXF8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC035044E0CXF8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC035044E0CXF8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BC035044E0CXF8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BC035044E0CXF8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BC035044E0CXF8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BC035044E0CXF8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BC035044E0CXF8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC035044E0CXF8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC035044E0CXF8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BC035044E0CXF8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC035044E0CXF8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC035044E0CXF8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC035044E0CXF8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC035044E0CXF8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC035044E0CXF8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BC035044E0CXF8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC035044E0CXF8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC035044E0CXF8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC035044E0CXF8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC035044E0CXF8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC035044E0CXF8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC035044E0CXF8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC035044E0CXF8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC035044E0CXF8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC035044E0CXF8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC035044E0CXF8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC035044E0CXF8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BC035044E0CXF8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC035044E0CXF8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC035044E0CXF8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC035044E0CXF8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC035044E0CXF8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC035044E0CXF8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC035044E0CXF8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC035044E0CXF8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC035044E0CXF8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC035044E0CXF8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC035044E0CXF8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC035044E0CXF8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC035044E0CXF8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BC035044E0CXF8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC035044E0CXF8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC035044E0CXF8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC035044E0CXF8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC035044E0CXF8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC035044E0CXF8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BC035044E0CXF8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BC035044E0CXF8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC035044E0CXF8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC035044E0CXF8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC035044E0CXF8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC035044E0CXF8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BC035044E0CXF8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BC035044E0CXF8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC035044E0CXF8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC035044E0CXF8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC035044E0CXF8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BC035044E0CXF8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BC035044E0CXF8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC035044E0CXF8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC035044E0CXF8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BC035044E0CXF8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC035044E0CXF8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BC035044E0CXF8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BC035044E0CXF8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC035044E0CXF8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC035044E0CXF8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC035044E0CXF8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC035044E0CXF8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC035044E0CXF8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC035044E0CXF8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC035044E0CXF8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC035044E0CXF8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BC035044E0CXF8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BC035044E0CXF8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
BC035044E0CXF8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BC035044E0CXF8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BC035044E0CXF8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BC035044E0CXF8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BC035044E0CXF8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BC035044E0CXF8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BC035044E0CXF8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BC035044E0CXF8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BC035044E0CXF8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
BC035044E0CXF8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BC035044E0CXF8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC035044E0CXF8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC035044E0CXF8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC035044E0CXF8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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