Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx6-2D3Z4R4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx6-2D3Z4R4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx6-2D3Z4R4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx6-2D3Z4R4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx6-2D3Z4R4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx6-2D3Z4R4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx6-2D3Z4R4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx6-2D3Z4R4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx6-2D3Z4R4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx6-2D3Z4R4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx6-2D3Z4R4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx6-2D3Z4R4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx6-2D3Z4R4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx6-2D3Z4R4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx6-2D3Z4R4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx6-2D3Z4R4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx6-2D3Z4R4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkx6-2D3Z4R4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nkx6-2D3Z4R4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx6-2D3Z4R4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx6-2D3Z4R4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx6-2D3Z4R4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx6-2D3Z4R4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkx6-2D3Z4R4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkx6-2D3Z4R4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkx6-2D3Z4R4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx6-2D3Z4R4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx6-2D3Z4R4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx6-2D3Z4R4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx6-2D3Z4R4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx6-2D3Z4R4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx6-2D3Z4R4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkx6-2D3Z4R4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx6-2D3Z4R4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx6-2D3Z4R4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx6-2D3Z4R4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx6-2D3Z4R4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx6-2D3Z4R4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx6-2D3Z4R4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx6-2D3Z4R4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx6-2D3Z4R4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx6-2D3Z4R4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx6-2D3Z4R4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx6-2D3Z4R4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx6-2D3Z4R4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx6-2D3Z4R4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx6-2D3Z4R4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx6-2D3Z4R4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx6-2D3Z4R4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx6-2D3Z4R4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx6-2D3Z4R4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx6-2D3Z4R4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx6-2D3Z4R4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx6-2D3Z4R4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx6-2D3Z4R4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx6-2D3Z4R4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx6-2D3Z4R4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nkx6-2D3Z4R4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx6-2D3Z4R4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx6-2D3Z4R4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx6-2D3Z4R4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx6-2D3Z4R4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx6-2D3Z4R4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx6-2D3Z4R4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx6-2D3Z4R4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx6-2D3Z4R4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx6-2D3Z4R4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx6-2D3Z4R4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx6-2D3Z4R4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx6-2D3Z4R4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx6-2D3Z4R4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx6-2D3Z4R4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx6-2D3Z4R4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nkx6-2D3Z4R4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx6-2D3Z4R4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx6-2D3Z4R4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx6-2D3Z4R4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx6-2D3Z4R4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkx6-2D3Z4R4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkx6-2D3Z4R4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nkx6-2D3Z4R4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nkx6-2D3Z4R4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nkx6-2D3Z4R4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms