Protein–RNA interactions for Protein: D3Z460

Gm1330, Predicted gene 1330, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1330D3Z460 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm1330D3Z460 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm1330D3Z460 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm1330D3Z460 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm1330D3Z460 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm1330D3Z460 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm1330D3Z460 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm1330D3Z460 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm1330D3Z460 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm1330D3Z460 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm1330D3Z460 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm1330D3Z460 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm1330D3Z460 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm1330D3Z460 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm1330D3Z460 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm1330D3Z460 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm1330D3Z460 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm1330D3Z460 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm1330D3Z460 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm1330D3Z460 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm1330D3Z460 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm1330D3Z460 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm1330D3Z460 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm1330D3Z460 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm1330D3Z460 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm1330D3Z460 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm1330D3Z460 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm1330D3Z460 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm1330D3Z460 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm1330D3Z460 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm1330D3Z460 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm1330D3Z460 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm1330D3Z460 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm1330D3Z460 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm1330D3Z460 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm1330D3Z460 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm1330D3Z460 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm1330D3Z460 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm1330D3Z460 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm1330D3Z460 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm1330D3Z460 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm1330D3Z460 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm1330D3Z460 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm1330D3Z460 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm1330D3Z460 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm1330D3Z460 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm1330D3Z460 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm1330D3Z460 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm1330D3Z460 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm1330D3Z460 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm1330D3Z460 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm1330D3Z460 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm1330D3Z460 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm1330D3Z460 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm1330D3Z460 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm1330D3Z460 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm1330D3Z460 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm1330D3Z460 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm1330D3Z460 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm1330D3Z460 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm1330D3Z460 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm1330D3Z460 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm1330D3Z460 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm1330D3Z460 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm1330D3Z460 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm1330D3Z460 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm1330D3Z460 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm1330D3Z460 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm1330D3Z460 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm1330D3Z460 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm1330D3Z460 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm1330D3Z460 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm1330D3Z460 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm1330D3Z460 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm1330D3Z460 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm1330D3Z460 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm1330D3Z460 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm1330D3Z460 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm1330D3Z460 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm1330D3Z460 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm1330D3Z460 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm1330D3Z460 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gm1330D3Z460 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm1330D3Z460 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm1330D3Z460 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm1330D3Z460 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm1330D3Z460 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm1330D3Z460 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm1330D3Z460 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm1330D3Z460 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm1330D3Z460 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm1330D3Z460 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm1330D3Z460 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm1330D3Z460 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm1330D3Z460 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm1330D3Z460 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm1330D3Z460 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm1330D3Z460 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm1330D3Z460 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm1330D3Z460 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms