Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1V9

Defa28, Defensin, alpha, 28, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa28D3Z1V9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa28D3Z1V9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa28D3Z1V9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa28D3Z1V9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa28D3Z1V9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa28D3Z1V9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa28D3Z1V9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa28D3Z1V9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa28D3Z1V9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa28D3Z1V9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa28D3Z1V9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa28D3Z1V9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa28D3Z1V9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa28D3Z1V9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa28D3Z1V9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa28D3Z1V9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa28D3Z1V9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa28D3Z1V9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa28D3Z1V9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa28D3Z1V9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa28D3Z1V9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa28D3Z1V9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa28D3Z1V9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa28D3Z1V9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa28D3Z1V9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa28D3Z1V9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa28D3Z1V9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa28D3Z1V9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa28D3Z1V9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa28D3Z1V9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa28D3Z1V9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa28D3Z1V9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa28D3Z1V9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa28D3Z1V9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa28D3Z1V9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa28D3Z1V9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa28D3Z1V9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa28D3Z1V9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa28D3Z1V9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa28D3Z1V9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa28D3Z1V9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa28D3Z1V9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa28D3Z1V9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa28D3Z1V9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa28D3Z1V9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa28D3Z1V9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa28D3Z1V9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa28D3Z1V9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa28D3Z1V9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa28D3Z1V9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa28D3Z1V9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa28D3Z1V9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa28D3Z1V9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa28D3Z1V9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa28D3Z1V9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa28D3Z1V9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa28D3Z1V9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa28D3Z1V9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa28D3Z1V9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa28D3Z1V9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa28D3Z1V9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa28D3Z1V9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa28D3Z1V9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa28D3Z1V9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa28D3Z1V9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa28D3Z1V9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa28D3Z1V9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa28D3Z1V9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa28D3Z1V9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa28D3Z1V9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa28D3Z1V9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa28D3Z1V9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa28D3Z1V9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa28D3Z1V9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa28D3Z1V9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa28D3Z1V9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa28D3Z1V9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa28D3Z1V9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Defa28D3Z1V9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa28D3Z1V9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa28D3Z1V9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa28D3Z1V9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa28D3Z1V9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa28D3Z1V9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa28D3Z1V9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa28D3Z1V9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa28D3Z1V9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa28D3Z1V9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa28D3Z1V9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa28D3Z1V9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa28D3Z1V9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa28D3Z1V9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa28D3Z1V9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa28D3Z1V9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa28D3Z1V9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa28D3Z1V9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa28D3Z1V9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa28D3Z1V9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa28D3Z1V9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa28D3Z1V9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms