Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cldn24D3YXJ9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cldn24D3YXJ9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cldn24D3YXJ9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cldn24D3YXJ9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cldn24D3YXJ9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cldn24D3YXJ9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cldn24D3YXJ9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cldn24D3YXJ9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cldn24D3YXJ9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cldn24D3YXJ9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cldn24D3YXJ9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cldn24D3YXJ9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cldn24D3YXJ9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cldn24D3YXJ9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cldn24D3YXJ9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cldn24D3YXJ9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cldn24D3YXJ9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cldn24D3YXJ9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cldn24D3YXJ9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cldn24D3YXJ9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cldn24D3YXJ9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cldn24D3YXJ9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cldn24D3YXJ9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cldn24D3YXJ9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cldn24D3YXJ9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cldn24D3YXJ9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cldn24D3YXJ9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cldn24D3YXJ9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cldn24D3YXJ9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cldn24D3YXJ9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cldn24D3YXJ9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cldn24D3YXJ9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cldn24D3YXJ9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cldn24D3YXJ9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cldn24D3YXJ9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cldn24D3YXJ9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cldn24D3YXJ9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cldn24D3YXJ9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cldn24D3YXJ9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cldn24D3YXJ9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cldn24D3YXJ9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cldn24D3YXJ9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cldn24D3YXJ9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cldn24D3YXJ9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cldn24D3YXJ9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cldn24D3YXJ9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cldn24D3YXJ9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cldn24D3YXJ9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cldn24D3YXJ9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cldn24D3YXJ9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cldn24D3YXJ9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cldn24D3YXJ9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cldn24D3YXJ9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cldn24D3YXJ9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cldn24D3YXJ9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cldn24D3YXJ9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cldn24D3YXJ9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cldn24D3YXJ9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cldn24D3YXJ9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cldn24D3YXJ9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cldn24D3YXJ9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cldn24D3YXJ9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldn24D3YXJ9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldn24D3YXJ9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldn24D3YXJ9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cldn24D3YXJ9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cldn24D3YXJ9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cldn24D3YXJ9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cldn24D3YXJ9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cldn24D3YXJ9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cldn24D3YXJ9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cldn24D3YXJ9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cldn24D3YXJ9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cldn24D3YXJ9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cldn24D3YXJ9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cldn24D3YXJ9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cldn24D3YXJ9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cldn24D3YXJ9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cldn24D3YXJ9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cldn24D3YXJ9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cldn24D3YXJ9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cldn24D3YXJ9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cldn24D3YXJ9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cldn24D3YXJ9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cldn24D3YXJ9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cldn24D3YXJ9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cldn24D3YXJ9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cldn24D3YXJ9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn24D3YXJ9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn24D3YXJ9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cldn24D3YXJ9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cldn24D3YXJ9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cldn24D3YXJ9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cldn24D3YXJ9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cldn24D3YXJ9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn24D3YXJ9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn24D3YXJ9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cldn24D3YXJ9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cldn24D3YXJ9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.6 ms