Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzd8B9EJ80 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdzd8B9EJ80 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdzd8B9EJ80 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd8B9EJ80 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd8B9EJ80 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd8B9EJ80 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd8B9EJ80 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd8B9EJ80 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzd8B9EJ80 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzd8B9EJ80 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzd8B9EJ80 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzd8B9EJ80 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzd8B9EJ80 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdzd8B9EJ80 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdzd8B9EJ80 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdzd8B9EJ80 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdzd8B9EJ80 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzd8B9EJ80 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzd8B9EJ80 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdzd8B9EJ80 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzd8B9EJ80 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzd8B9EJ80 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzd8B9EJ80 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzd8B9EJ80 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzd8B9EJ80 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzd8B9EJ80 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzd8B9EJ80 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd8B9EJ80 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd8B9EJ80 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd8B9EJ80 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd8B9EJ80 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd8B9EJ80 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd8B9EJ80 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd8B9EJ80 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd8B9EJ80 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd8B9EJ80 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzd8B9EJ80 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzd8B9EJ80 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzd8B9EJ80 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdzd8B9EJ80 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdzd8B9EJ80 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdzd8B9EJ80 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzd8B9EJ80 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzd8B9EJ80 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzd8B9EJ80 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzd8B9EJ80 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzd8B9EJ80 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzd8B9EJ80 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzd8B9EJ80 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzd8B9EJ80 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzd8B9EJ80 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzd8B9EJ80 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzd8B9EJ80 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzd8B9EJ80 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzd8B9EJ80 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzd8B9EJ80 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzd8B9EJ80 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzd8B9EJ80 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzd8B9EJ80 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzd8B9EJ80 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzd8B9EJ80 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzd8B9EJ80 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdzd8B9EJ80 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdzd8B9EJ80 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdzd8B9EJ80 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdzd8B9EJ80 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzd8B9EJ80 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzd8B9EJ80 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzd8B9EJ80 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzd8B9EJ80 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzd8B9EJ80 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzd8B9EJ80 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdzd8B9EJ80 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzd8B9EJ80 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzd8B9EJ80 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdzd8B9EJ80 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdzd8B9EJ80 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdzd8B9EJ80 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdzd8B9EJ80 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd8B9EJ80 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd8B9EJ80 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd8B9EJ80 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd8B9EJ80 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd8B9EJ80 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd8B9EJ80 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzd8B9EJ80 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd8B9EJ80 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd8B9EJ80 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd8B9EJ80 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd8B9EJ80 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzd8B9EJ80 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzd8B9EJ80 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd8B9EJ80 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd8B9EJ80 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzd8B9EJ80 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd8B9EJ80 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd8B9EJ80 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd8B9EJ80 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzd8B9EJ80 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms