Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ankrd34aB2RW11 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ankrd34aB2RW11 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ankrd34aB2RW11 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ankrd34aB2RW11 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ankrd34aB2RW11 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ankrd34aB2RW11 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ankrd34aB2RW11 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ankrd34aB2RW11 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ankrd34aB2RW11 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ankrd34aB2RW11 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ankrd34aB2RW11 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ankrd34aB2RW11 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ankrd34aB2RW11 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ankrd34aB2RW11 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ankrd34aB2RW11 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ankrd34aB2RW11 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ankrd34aB2RW11 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ankrd34aB2RW11 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ankrd34aB2RW11 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ankrd34aB2RW11 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ankrd34aB2RW11 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ankrd34aB2RW11 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ankrd34aB2RW11 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ankrd34aB2RW11 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ankrd34aB2RW11 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ankrd34aB2RW11 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ankrd34aB2RW11 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ankrd34aB2RW11 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ankrd34aB2RW11 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ankrd34aB2RW11 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ankrd34aB2RW11 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ankrd34aB2RW11 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ankrd34aB2RW11 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ankrd34aB2RW11 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ankrd34aB2RW11 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ankrd34aB2RW11 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ankrd34aB2RW11 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ankrd34aB2RW11 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ankrd34aB2RW11 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ankrd34aB2RW11 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ankrd34aB2RW11 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ankrd34aB2RW11 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ankrd34aB2RW11 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ankrd34aB2RW11 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ankrd34aB2RW11 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ankrd34aB2RW11 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ankrd34aB2RW11 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ankrd34aB2RW11 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ankrd34aB2RW11 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ankrd34aB2RW11 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ankrd34aB2RW11 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ankrd34aB2RW11 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ankrd34aB2RW11 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ankrd34aB2RW11 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ankrd34aB2RW11 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ankrd34aB2RW11 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ankrd34aB2RW11 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ankrd34aB2RW11 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ankrd34aB2RW11 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ankrd34aB2RW11 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ankrd34aB2RW11 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ankrd34aB2RW11 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ankrd34aB2RW11 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ankrd34aB2RW11 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ankrd34aB2RW11 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ankrd34aB2RW11 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ankrd34aB2RW11 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ankrd34aB2RW11 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ankrd34aB2RW11 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ankrd34aB2RW11 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ankrd34aB2RW11 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ankrd34aB2RW11 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ankrd34aB2RW11 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ankrd34aB2RW11 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ankrd34aB2RW11 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ankrd34aB2RW11 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ankrd34aB2RW11 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ankrd34aB2RW11 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ankrd34aB2RW11 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ankrd34aB2RW11 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ankrd34aB2RW11 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ankrd34aB2RW11 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ankrd34aB2RW11 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ankrd34aB2RW11 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ankrd34aB2RW11 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ankrd34aB2RW11 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ankrd34aB2RW11 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ankrd34aB2RW11 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ankrd34aB2RW11 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ankrd34aB2RW11 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ankrd34aB2RW11 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ankrd34aB2RW11 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ankrd34aB2RW11 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ankrd34aB2RW11 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ankrd34aB2RW11 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ankrd34aB2RW11 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ankrd34aB2RW11 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ankrd34aB2RW11 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ankrd34aB2RW11 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms