Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Brpf1B2RRD7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Brpf1B2RRD7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Brpf1B2RRD7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Brpf1B2RRD7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Brpf1B2RRD7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Brpf1B2RRD7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Brpf1B2RRD7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Brpf1B2RRD7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Brpf1B2RRD7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Brpf1B2RRD7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Brpf1B2RRD7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Brpf1B2RRD7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Brpf1B2RRD7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Brpf1B2RRD7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Brpf1B2RRD7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Brpf1B2RRD7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Brpf1B2RRD7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Brpf1B2RRD7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Brpf1B2RRD7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Brpf1B2RRD7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.61
Brpf1B2RRD7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Brpf1B2RRD7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Brpf1B2RRD7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Brpf1B2RRD7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Brpf1B2RRD7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Brpf1B2RRD7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Brpf1B2RRD7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Brpf1B2RRD7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Brpf1B2RRD7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Brpf1B2RRD7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Brpf1B2RRD7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Brpf1B2RRD7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Brpf1B2RRD7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Brpf1B2RRD7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Brpf1B2RRD7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Brpf1B2RRD7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Brpf1B2RRD7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Brpf1B2RRD7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Brpf1B2RRD7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Brpf1B2RRD7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Brpf1B2RRD7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Brpf1B2RRD7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Brpf1B2RRD7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Brpf1B2RRD7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Brpf1B2RRD7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Brpf1B2RRD7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Brpf1B2RRD7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Brpf1B2RRD7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Brpf1B2RRD7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Brpf1B2RRD7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Brpf1B2RRD7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Brpf1B2RRD7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Brpf1B2RRD7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Brpf1B2RRD7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Brpf1B2RRD7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Brpf1B2RRD7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Brpf1B2RRD7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Brpf1B2RRD7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Brpf1B2RRD7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Brpf1B2RRD7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Brpf1B2RRD7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Brpf1B2RRD7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Brpf1B2RRD7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Brpf1B2RRD7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Brpf1B2RRD7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Brpf1B2RRD7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Brpf1B2RRD7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Brpf1B2RRD7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Brpf1B2RRD7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Brpf1B2RRD7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Brpf1B2RRD7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Brpf1B2RRD7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Brpf1B2RRD7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Brpf1B2RRD7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Brpf1B2RRD7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Brpf1B2RRD7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Brpf1B2RRD7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Brpf1B2RRD7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Brpf1B2RRD7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Brpf1B2RRD7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
Brpf1B2RRD7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Brpf1B2RRD7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Brpf1B2RRD7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Brpf1B2RRD7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Brpf1B2RRD7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Brpf1B2RRD7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Brpf1B2RRD7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Brpf1B2RRD7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Brpf1B2RRD7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Brpf1B2RRD7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Brpf1B2RRD7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Brpf1B2RRD7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Brpf1B2RRD7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Brpf1B2RRD7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Brpf1B2RRD7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Brpf1B2RRD7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Brpf1B2RRD7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Brpf1B2RRD7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Brpf1B2RRD7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms