Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
NhsB1AV60 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC40.02■■■■■ 4
NhsB1AV60 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
NhsB1AV60 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
NhsB1AV60 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
NhsB1AV60 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
NhsB1AV60 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
NhsB1AV60 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
NhsB1AV60 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
NhsB1AV60 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
NhsB1AV60 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
NhsB1AV60 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
NhsB1AV60 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
NhsB1AV60 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.99
NhsB1AV60 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
NhsB1AV60 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
NhsB1AV60 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
NhsB1AV60 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
NhsB1AV60 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
NhsB1AV60 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
NhsB1AV60 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
NhsB1AV60 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
NhsB1AV60 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
NhsB1AV60 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
NhsB1AV60 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
NhsB1AV60 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
NhsB1AV60 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
NhsB1AV60 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
NhsB1AV60 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
NhsB1AV60 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
NhsB1AV60 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
NhsB1AV60 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
NhsB1AV60 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
NhsB1AV60 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
NhsB1AV60 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
NhsB1AV60 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
NhsB1AV60 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
NhsB1AV60 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
NhsB1AV60 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
NhsB1AV60 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
NhsB1AV60 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
NhsB1AV60 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
NhsB1AV60 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
NhsB1AV60 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
NhsB1AV60 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
NhsB1AV60 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
NhsB1AV60 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
NhsB1AV60 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
NhsB1AV60 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC39.44■■■■□ 3.9
NhsB1AV60 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
NhsB1AV60 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
NhsB1AV60 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
NhsB1AV60 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
NhsB1AV60 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC39.41■■■■□ 3.9
NhsB1AV60 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
NhsB1AV60 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
NhsB1AV60 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
NhsB1AV60 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC39.37■■■■□ 3.89
NhsB1AV60 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC39.36■■■■□ 3.89
NhsB1AV60 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
NhsB1AV60 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
NhsB1AV60 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
NhsB1AV60 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
NhsB1AV60 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
NhsB1AV60 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
NhsB1AV60 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
NhsB1AV60 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
NhsB1AV60 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
NhsB1AV60 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
NhsB1AV60 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
NhsB1AV60 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
NhsB1AV60 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NhsB1AV60 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NhsB1AV60 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
NhsB1AV60 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
NhsB1AV60 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
NhsB1AV60 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC39.2■■■■□ 3.87
NhsB1AV60 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
NhsB1AV60 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
NhsB1AV60 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
NhsB1AV60 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NhsB1AV60 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NhsB1AV60 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NhsB1AV60 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NhsB1AV60 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC39.14■■■■□ 3.86
NhsB1AV60 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
NhsB1AV60 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
NhsB1AV60 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
NhsB1AV60 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
NhsB1AV60 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
NhsB1AV60 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
NhsB1AV60 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
NhsB1AV60 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
NhsB1AV60 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
NhsB1AV60 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
NhsB1AV60 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
NhsB1AV60 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
NhsB1AV60 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
NhsB1AV60 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
NhsB1AV60 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms