Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm5640A3KG49 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm5640A3KG49 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm5640A3KG49 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm5640A3KG49 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm5640A3KG49 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm5640A3KG49 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm5640A3KG49 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm5640A3KG49 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm5640A3KG49 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm5640A3KG49 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm5640A3KG49 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm5640A3KG49 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm5640A3KG49 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm5640A3KG49 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm5640A3KG49 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm5640A3KG49 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm5640A3KG49 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm5640A3KG49 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm5640A3KG49 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm5640A3KG49 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm5640A3KG49 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm5640A3KG49 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm5640A3KG49 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm5640A3KG49 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm5640A3KG49 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm5640A3KG49 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm5640A3KG49 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm5640A3KG49 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm5640A3KG49 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm5640A3KG49 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm5640A3KG49 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm5640A3KG49 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm5640A3KG49 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm5640A3KG49 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm5640A3KG49 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm5640A3KG49 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm5640A3KG49 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm5640A3KG49 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5640A3KG49 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5640A3KG49 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5640A3KG49 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm5640A3KG49 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm5640A3KG49 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm5640A3KG49 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm5640A3KG49 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm5640A3KG49 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm5640A3KG49 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm5640A3KG49 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm5640A3KG49 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm5640A3KG49 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm5640A3KG49 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm5640A3KG49 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm5640A3KG49 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm5640A3KG49 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm5640A3KG49 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm5640A3KG49 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm5640A3KG49 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm5640A3KG49 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm5640A3KG49 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm5640A3KG49 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm5640A3KG49 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm5640A3KG49 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm5640A3KG49 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm5640A3KG49 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm5640A3KG49 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm5640A3KG49 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gm5640A3KG49 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm5640A3KG49 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm5640A3KG49 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm5640A3KG49 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm5640A3KG49 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm5640A3KG49 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm5640A3KG49 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm5640A3KG49 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm5640A3KG49 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm5640A3KG49 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm5640A3KG49 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm5640A3KG49 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm5640A3KG49 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm5640A3KG49 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm5640A3KG49 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm5640A3KG49 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm5640A3KG49 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm5640A3KG49 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm5640A3KG49 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm5640A3KG49 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm5640A3KG49 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm5640A3KG49 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm5640A3KG49 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5640A3KG49 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5640A3KG49 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5640A3KG49 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm5640A3KG49 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm5640A3KG49 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gm5640A3KG49 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm5640A3KG49 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm5640A3KG49 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm5640A3KG49 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm5640A3KG49 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms