Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klhl41A2AUC9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Klhl41A2AUC9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Klhl41A2AUC9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Klhl41A2AUC9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Klhl41A2AUC9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klhl41A2AUC9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klhl41A2AUC9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klhl41A2AUC9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klhl41A2AUC9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klhl41A2AUC9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klhl41A2AUC9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klhl41A2AUC9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klhl41A2AUC9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Klhl41A2AUC9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Klhl41A2AUC9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Klhl41A2AUC9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Klhl41A2AUC9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Klhl41A2AUC9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Klhl41A2AUC9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Klhl41A2AUC9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Klhl41A2AUC9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Klhl41A2AUC9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Klhl41A2AUC9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Klhl41A2AUC9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Klhl41A2AUC9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Klhl41A2AUC9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Klhl41A2AUC9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Klhl41A2AUC9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Klhl41A2AUC9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Klhl41A2AUC9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Klhl41A2AUC9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Klhl41A2AUC9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Klhl41A2AUC9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Klhl41A2AUC9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Klhl41A2AUC9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Klhl41A2AUC9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Klhl41A2AUC9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Klhl41A2AUC9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klhl41A2AUC9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Klhl41A2AUC9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Klhl41A2AUC9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Klhl41A2AUC9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhl41A2AUC9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhl41A2AUC9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Klhl41A2AUC9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhl41A2AUC9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhl41A2AUC9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhl41A2AUC9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhl41A2AUC9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhl41A2AUC9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhl41A2AUC9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhl41A2AUC9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Klhl41A2AUC9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Klhl41A2AUC9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Klhl41A2AUC9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Klhl41A2AUC9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Klhl41A2AUC9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Klhl41A2AUC9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Klhl41A2AUC9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Klhl41A2AUC9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klhl41A2AUC9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Klhl41A2AUC9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Klhl41A2AUC9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Klhl41A2AUC9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Klhl41A2AUC9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klhl41A2AUC9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klhl41A2AUC9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klhl41A2AUC9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klhl41A2AUC9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klhl41A2AUC9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klhl41A2AUC9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Klhl41A2AUC9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Klhl41A2AUC9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klhl41A2AUC9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klhl41A2AUC9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klhl41A2AUC9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Klhl41A2AUC9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Klhl41A2AUC9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhl41A2AUC9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhl41A2AUC9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Klhl41A2AUC9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Klhl41A2AUC9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Klhl41A2AUC9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Klhl41A2AUC9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Klhl41A2AUC9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Klhl41A2AUC9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Klhl41A2AUC9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Klhl41A2AUC9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klhl41A2AUC9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klhl41A2AUC9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klhl41A2AUC9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klhl41A2AUC9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klhl41A2AUC9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Klhl41A2AUC9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Klhl41A2AUC9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Klhl41A2AUC9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klhl41A2AUC9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klhl41A2AUC9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Klhl41A2AUC9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms