Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramef25A2ASI9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramef25A2ASI9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramef25A2ASI9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pramef25A2ASI9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pramef25A2ASI9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pramef25A2ASI9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramef25A2ASI9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramef25A2ASI9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pramef25A2ASI9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pramef25A2ASI9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pramef25A2ASI9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef25A2ASI9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramef25A2ASI9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramef25A2ASI9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramef25A2ASI9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramef25A2ASI9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramef25A2ASI9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramef25A2ASI9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pramef25A2ASI9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pramef25A2ASI9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramef25A2ASI9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramef25A2ASI9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramef25A2ASI9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramef25A2ASI9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramef25A2ASI9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pramef25A2ASI9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pramef25A2ASI9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pramef25A2ASI9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pramef25A2ASI9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pramef25A2ASI9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef25A2ASI9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef25A2ASI9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef25A2ASI9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef25A2ASI9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramef25A2ASI9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramef25A2ASI9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pramef25A2ASI9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pramef25A2ASI9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pramef25A2ASI9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pramef25A2ASI9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pramef25A2ASI9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pramef25A2ASI9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pramef25A2ASI9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pramef25A2ASI9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramef25A2ASI9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pramef25A2ASI9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pramef25A2ASI9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pramef25A2ASI9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pramef25A2ASI9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pramef25A2ASI9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pramef25A2ASI9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef25A2ASI9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pramef25A2ASI9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pramef25A2ASI9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pramef25A2ASI9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pramef25A2ASI9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pramef25A2ASI9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pramef25A2ASI9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramef25A2ASI9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramef25A2ASI9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramef25A2ASI9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramef25A2ASI9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramef25A2ASI9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramef25A2ASI9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramef25A2ASI9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pramef25A2ASI9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramef25A2ASI9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramef25A2ASI9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pramef25A2ASI9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pramef25A2ASI9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramef25A2ASI9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramef25A2ASI9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramef25A2ASI9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramef25A2ASI9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramef25A2ASI9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramef25A2ASI9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramef25A2ASI9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramef25A2ASI9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramef25A2ASI9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramef25A2ASI9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramef25A2ASI9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramef25A2ASI9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramef25A2ASI9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef25A2ASI9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef25A2ASI9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramef25A2ASI9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramef25A2ASI9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramef25A2ASI9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramef25A2ASI9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramef25A2ASI9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef25A2ASI9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef25A2ASI9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef25A2ASI9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramef25A2ASI9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramef25A2ASI9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramef25A2ASI9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pramef25A2ASI9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramef25A2ASI9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramef25A2ASI9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms