Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdccag3A2AIW0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sdccag3A2AIW0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sdccag3A2AIW0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdccag3A2AIW0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdccag3A2AIW0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdccag3A2AIW0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdccag3A2AIW0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdccag3A2AIW0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdccag3A2AIW0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdccag3A2AIW0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdccag3A2AIW0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdccag3A2AIW0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdccag3A2AIW0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdccag3A2AIW0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdccag3A2AIW0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdccag3A2AIW0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdccag3A2AIW0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdccag3A2AIW0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdccag3A2AIW0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdccag3A2AIW0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdccag3A2AIW0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdccag3A2AIW0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdccag3A2AIW0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdccag3A2AIW0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdccag3A2AIW0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdccag3A2AIW0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdccag3A2AIW0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdccag3A2AIW0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdccag3A2AIW0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdccag3A2AIW0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdccag3A2AIW0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdccag3A2AIW0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdccag3A2AIW0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdccag3A2AIW0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdccag3A2AIW0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdccag3A2AIW0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdccag3A2AIW0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdccag3A2AIW0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdccag3A2AIW0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdccag3A2AIW0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdccag3A2AIW0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdccag3A2AIW0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdccag3A2AIW0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sdccag3A2AIW0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sdccag3A2AIW0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdccag3A2AIW0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdccag3A2AIW0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdccag3A2AIW0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdccag3A2AIW0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdccag3A2AIW0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdccag3A2AIW0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdccag3A2AIW0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdccag3A2AIW0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdccag3A2AIW0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdccag3A2AIW0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdccag3A2AIW0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdccag3A2AIW0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdccag3A2AIW0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdccag3A2AIW0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdccag3A2AIW0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdccag3A2AIW0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdccag3A2AIW0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdccag3A2AIW0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdccag3A2AIW0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdccag3A2AIW0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdccag3A2AIW0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdccag3A2AIW0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdccag3A2AIW0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdccag3A2AIW0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdccag3A2AIW0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdccag3A2AIW0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdccag3A2AIW0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdccag3A2AIW0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdccag3A2AIW0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdccag3A2AIW0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdccag3A2AIW0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdccag3A2AIW0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdccag3A2AIW0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdccag3A2AIW0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdccag3A2AIW0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdccag3A2AIW0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdccag3A2AIW0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdccag3A2AIW0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdccag3A2AIW0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdccag3A2AIW0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdccag3A2AIW0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdccag3A2AIW0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdccag3A2AIW0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdccag3A2AIW0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdccag3A2AIW0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdccag3A2AIW0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdccag3A2AIW0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sdccag3A2AIW0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sdccag3A2AIW0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdccag3A2AIW0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdccag3A2AIW0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdccag3A2AIW0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdccag3A2AIW0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdccag3A2AIW0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms