Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprfA2A8L5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprfA2A8L5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprfA2A8L5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprfA2A8L5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprfA2A8L5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprfA2A8L5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprfA2A8L5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprfA2A8L5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprfA2A8L5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprfA2A8L5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprfA2A8L5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprfA2A8L5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprfA2A8L5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprfA2A8L5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprfA2A8L5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprfA2A8L5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprfA2A8L5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprfA2A8L5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprfA2A8L5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprfA2A8L5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprfA2A8L5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprfA2A8L5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprfA2A8L5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprfA2A8L5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprfA2A8L5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprfA2A8L5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprfA2A8L5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprfA2A8L5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprfA2A8L5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprfA2A8L5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprfA2A8L5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprfA2A8L5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprfA2A8L5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PtprfA2A8L5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtprfA2A8L5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtprfA2A8L5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtprfA2A8L5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprfA2A8L5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprfA2A8L5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprfA2A8L5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprfA2A8L5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprfA2A8L5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprfA2A8L5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprfA2A8L5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprfA2A8L5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprfA2A8L5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprfA2A8L5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprfA2A8L5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprfA2A8L5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprfA2A8L5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprfA2A8L5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprfA2A8L5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprfA2A8L5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprfA2A8L5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprfA2A8L5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprfA2A8L5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprfA2A8L5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprfA2A8L5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprfA2A8L5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprfA2A8L5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprfA2A8L5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtprfA2A8L5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtprfA2A8L5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtprfA2A8L5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprfA2A8L5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprfA2A8L5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprfA2A8L5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprfA2A8L5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprfA2A8L5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprfA2A8L5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprfA2A8L5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprfA2A8L5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprfA2A8L5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprfA2A8L5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprfA2A8L5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprfA2A8L5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprfA2A8L5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprfA2A8L5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprfA2A8L5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprfA2A8L5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprfA2A8L5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprfA2A8L5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprfA2A8L5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprfA2A8L5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtprfA2A8L5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PtprfA2A8L5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprfA2A8L5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprfA2A8L5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprfA2A8L5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprfA2A8L5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprfA2A8L5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprfA2A8L5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprfA2A8L5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprfA2A8L5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprfA2A8L5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprfA2A8L5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprfA2A8L5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprfA2A8L5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprfA2A8L5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms