Protein–RNA interactions for Protein: A2A7W1

Cd300ld4, CD300 molecule-like family member D4, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld4A2A7W1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd300ld4A2A7W1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd300ld4A2A7W1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd300ld4A2A7W1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd300ld4A2A7W1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd300ld4A2A7W1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd300ld4A2A7W1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd300ld4A2A7W1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd300ld4A2A7W1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd300ld4A2A7W1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd300ld4A2A7W1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd300ld4A2A7W1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd300ld4A2A7W1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd300ld4A2A7W1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd300ld4A2A7W1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd300ld4A2A7W1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd300ld4A2A7W1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd300ld4A2A7W1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd300ld4A2A7W1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd300ld4A2A7W1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd300ld4A2A7W1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd300ld4A2A7W1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd300ld4A2A7W1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd300ld4A2A7W1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd300ld4A2A7W1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd300ld4A2A7W1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd300ld4A2A7W1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd300ld4A2A7W1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd300ld4A2A7W1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cd300ld4A2A7W1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd300ld4A2A7W1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd300ld4A2A7W1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd300ld4A2A7W1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd300ld4A2A7W1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd300ld4A2A7W1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd300ld4A2A7W1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd300ld4A2A7W1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd300ld4A2A7W1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd300ld4A2A7W1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd300ld4A2A7W1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd300ld4A2A7W1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd300ld4A2A7W1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd300ld4A2A7W1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd300ld4A2A7W1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd300ld4A2A7W1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd300ld4A2A7W1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd300ld4A2A7W1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd300ld4A2A7W1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd300ld4A2A7W1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd300ld4A2A7W1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd300ld4A2A7W1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd300ld4A2A7W1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd300ld4A2A7W1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd300ld4A2A7W1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd300ld4A2A7W1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd300ld4A2A7W1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd300ld4A2A7W1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd300ld4A2A7W1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd300ld4A2A7W1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd300ld4A2A7W1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd300ld4A2A7W1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd300ld4A2A7W1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd300ld4A2A7W1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd300ld4A2A7W1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd300ld4A2A7W1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd300ld4A2A7W1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd300ld4A2A7W1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd300ld4A2A7W1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd300ld4A2A7W1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd300ld4A2A7W1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cd300ld4A2A7W1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cd300ld4A2A7W1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cd300ld4A2A7W1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd300ld4A2A7W1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd300ld4A2A7W1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd300ld4A2A7W1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd300ld4A2A7W1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd300ld4A2A7W1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd300ld4A2A7W1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd300ld4A2A7W1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd300ld4A2A7W1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd300ld4A2A7W1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd300ld4A2A7W1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd300ld4A2A7W1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd300ld4A2A7W1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd300ld4A2A7W1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd300ld4A2A7W1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd300ld4A2A7W1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd300ld4A2A7W1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300ld4A2A7W1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300ld4A2A7W1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd300ld4A2A7W1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd300ld4A2A7W1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd300ld4A2A7W1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd300ld4A2A7W1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd300ld4A2A7W1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd300ld4A2A7W1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd300ld4A2A7W1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd300ld4A2A7W1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd300ld4A2A7W1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms