Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc173A0JLY1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc173A0JLY1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc173A0JLY1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc173A0JLY1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc173A0JLY1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc173A0JLY1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc173A0JLY1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc173A0JLY1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc173A0JLY1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc173A0JLY1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc173A0JLY1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc173A0JLY1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc173A0JLY1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc173A0JLY1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc173A0JLY1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccdc173A0JLY1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccdc173A0JLY1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc173A0JLY1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc173A0JLY1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc173A0JLY1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc173A0JLY1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc173A0JLY1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc173A0JLY1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc173A0JLY1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc173A0JLY1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc173A0JLY1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc173A0JLY1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc173A0JLY1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc173A0JLY1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc173A0JLY1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc173A0JLY1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ccdc173A0JLY1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc173A0JLY1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc173A0JLY1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc173A0JLY1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc173A0JLY1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc173A0JLY1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc173A0JLY1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc173A0JLY1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc173A0JLY1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc173A0JLY1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc173A0JLY1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc173A0JLY1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc173A0JLY1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc173A0JLY1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc173A0JLY1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc173A0JLY1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc173A0JLY1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc173A0JLY1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc173A0JLY1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc173A0JLY1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc173A0JLY1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc173A0JLY1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc173A0JLY1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc173A0JLY1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc173A0JLY1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc173A0JLY1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc173A0JLY1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc173A0JLY1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc173A0JLY1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc173A0JLY1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc173A0JLY1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc173A0JLY1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc173A0JLY1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc173A0JLY1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc173A0JLY1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc173A0JLY1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc173A0JLY1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc173A0JLY1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc173A0JLY1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc173A0JLY1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc173A0JLY1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc173A0JLY1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc173A0JLY1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc173A0JLY1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc173A0JLY1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc173A0JLY1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc173A0JLY1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc173A0JLY1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc173A0JLY1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc173A0JLY1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc173A0JLY1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc173A0JLY1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc173A0JLY1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc173A0JLY1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc173A0JLY1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc173A0JLY1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc173A0JLY1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc173A0JLY1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc173A0JLY1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc173A0JLY1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc173A0JLY1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc173A0JLY1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc173A0JLY1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc173A0JLY1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc173A0JLY1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc173A0JLY1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc173A0JLY1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc173A0JLY1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms