Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700018G05RikA0A1B0GSI2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700018G05RikA0A1B0GSI2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700018G05RikA0A1B0GSI2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
1700018G05RikA0A1B0GSI2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms