Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv23A0A0A6YWQ1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv23A0A0A6YWQ1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trbv23A0A0A6YWQ1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trbv23A0A0A6YWQ1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv23A0A0A6YWQ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trbv23A0A0A6YWQ1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trbv23A0A0A6YWQ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trbv23A0A0A6YWQ1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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