Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plod3Q9R0E1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms