Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gpc1Q9QZF2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms