Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trpc3Q9QZC1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trpc3Q9QZC1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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Trpc3Q9QZC1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trpc3Q9QZC1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
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Trpc3Q9QZC1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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Trpc3Q9QZC1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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Trpc3Q9QZC1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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Trpc3Q9QZC1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Trpc3Q9QZC1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trpc3Q9QZC1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Trpc3Q9QZC1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trpc3Q9QZC1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trpc3Q9QZC1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trpc3Q9QZC1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trpc3Q9QZC1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Trpc3Q9QZC1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trpc3Q9QZC1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trpc3Q9QZC1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trpc3Q9QZC1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trpc3Q9QZC1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trpc3Q9QZC1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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Trpc3Q9QZC1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Trpc3Q9QZC1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Trpc3Q9QZC1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Trpc3Q9QZC1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Trpc3Q9QZC1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Trpc3Q9QZC1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Trpc3Q9QZC1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Trpc3Q9QZC1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trpc3Q9QZC1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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