Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms