Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWT9

Kifc1, Kinesin-like protein KIFC1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifc1Q9QWT9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kifc1Q9QWT9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Kifc1Q9QWT9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Kifc1Q9QWT9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Kifc1Q9QWT9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kifc1Q9QWT9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kifc1Q9QWT9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Kifc1Q9QWT9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kifc1Q9QWT9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kifc1Q9QWT9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.1 ms