Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
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Col5a3Q9JLI2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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