Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms