Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herpud1Q9JJK5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms