Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms