Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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Cldn19Q9ET38 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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Cldn19Q9ET38 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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Cldn19Q9ET38 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Cldn19Q9ET38 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Cldn19Q9ET38 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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Cldn19Q9ET38 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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