Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms