Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pfn4Q9D6I3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pfn4Q9D6I3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pfn4Q9D6I3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pfn4Q9D6I3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pfn4Q9D6I3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pfn4Q9D6I3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pfn4Q9D6I3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pfn4Q9D6I3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pfn4Q9D6I3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pfn4Q9D6I3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pfn4Q9D6I3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfn4Q9D6I3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfn4Q9D6I3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfn4Q9D6I3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfn4Q9D6I3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfn4Q9D6I3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfn4Q9D6I3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfn4Q9D6I3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfn4Q9D6I3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfn4Q9D6I3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfn4Q9D6I3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms