Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc105Q9D4K7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms