Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D7

Tmem30c, Cell cycle control protein 50C, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem30cQ9D4D7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem30cQ9D4D7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem30cQ9D4D7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms