Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spns3Q9D232 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms