Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlgn1Q99K10 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms