Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrit1Q8K099 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
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