Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atad2Q8CDM1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atad2Q8CDM1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atad2Q8CDM1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atad2Q8CDM1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atad2Q8CDM1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atad2Q8CDM1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atad2Q8CDM1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atad2Q8CDM1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Atad2Q8CDM1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atad2Q8CDM1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atad2Q8CDM1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atad2Q8CDM1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atad2Q8CDM1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atad2Q8CDM1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atad2Q8CDM1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atad2Q8CDM1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atad2Q8CDM1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atad2Q8CDM1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atad2Q8CDM1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atad2Q8CDM1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atad2Q8CDM1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atad2Q8CDM1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atad2Q8CDM1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atad2Q8CDM1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atad2Q8CDM1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atad2Q8CDM1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atad2Q8CDM1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atad2Q8CDM1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atad2Q8CDM1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atad2Q8CDM1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atad2Q8CDM1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms