Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms