Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Pdcl3Q8BVF2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Pdcl3Q8BVF2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Pdcl3Q8BVF2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Pdcl3Q8BVF2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Pdcl3Q8BVF2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Pdcl3Q8BVF2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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Pdcl3Q8BVF2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
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Pdcl3Q8BVF2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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Pdcl3Q8BVF2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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